ترومبوز سینوس کاورنو یکی از اصلی ترین عوارض عفونت سر و گردن است. این عارضه ممکن است در اثر عفونت فک بالا و پایین ایجاد شود. قبل از کشف پنی سیلین پروگنوز آن ضعیف بود؛ 90 تا 100 درصد بیماران در عرض 5 روز از توکسمی پیشرفته یا مننژیت می میرند. دندانپزشک باید قادر به تشخیص علائم اولیه ی ترومبوز سینوس کاورنو باشد و بیمار را سریعاً برای مراقبت بیمارستانی به متخصص ارجاع دهد.
ترومبوز سینوس کاورنو ممکن است در اثر انتشار مستقیم استئومیلیت ناشی از عفونت استافیلو کوکی یا ترمبوز وریدی که از سیستم وریدی منشأ می گیرد از فضای تحت گیجگاهی از طریق فورامینا یا استخوان ایجاد شود. یکی از سه مسیر معمولاً درگیر می شود: ورید فیشیال، ورید انگولار یا ورید افتالمیک فوقانی به سینوس های کاورنو؛ ورید عمقی صورت، شبکه ی وریدی ترگوئید و ورید های امیساری به سینوس های کاورنو؛ یا ورید ماگزیلاری (فک های بالا و پایین را تخلیه می کند) به شبکه ی وریدی تریگوئید و از آن جا به سینوس های کاورنو می رسند.
آبسه ی مغزی ممکن است از باکتریمی یا انتشار مستقیم عفونت ایجاد شود و امکان آن وجود دارد که به صورت یک آبسه ی تکی و یا چندگانه بروز کند و همچنین ممکن است همیشه در طرفی که دندان یا ایمپلنت درگیر وجود دارند قرار نگرفته باشد. علائم کلینیکی عبارتند از جمله ی تشنج، سر درد، گیجی، تته پته کردن و همی پارسیس (فلج یا ضعف یک طرفه ی بدن). بیمار ممکن است به مننژیت مبتلا شود و در عرض 2 تا 6 هفته بمیرد. آبسه ی مغزی پس از جراحی سینوس نیز گزارش شده است.